A neonatologia tem como objetivo complementar a formação dos médicos pediatras, é a especialidade médica que contempla áreas dos cuidados clínicos e intensivos aos bebês. Desde o nascimento (sala de parto), em alojamento conjunto (pós-parto), e dos que necessitam de cuidados intermediários (UCI e UCINCA) ou intensivos neonatais (UTIN), por meio de treinamentos que estimulam o raciocínio clínico, habilidades e competências.

A Anestesiologia é a especialidade médica dedicada às práticas em analgesia no centro cirúrgico e demais áreas do hospital. Para melhorar ainda mais o desempenho acadêmico dos residentes em serviço, atividades rotineiras de ensino como discussões de casos clínicos, discussões de avaliação pré-anestésica e cenários simulados são constantemente realizadas. O programa dispõe de preceptores especialistas em Medicina Intervencionista da dor, o que permite treinamentos constantes no uso de ultrassom para facilitar os bloqueios analgésicos.

O Programa de Residência em Ginecologia e Obstetrícia proporciona aos médicos residentes, a vivência na atenção básica até a alta complexidade. Os residentes estão ativamente envolvidos em diferentes cenários dentro da especialidade, especialmente assistência a gestantes e puérperas de alto risco, sendo a referência nesse serviço para nona regional de saúde, exames obstétricos, urgências e emergências materno-fetal, parceria com atenção primária em ginecologia, oncologia ginecológica, cirurgia ginecológica, oncologia ginecológica, mama, uroginecologia e cirurgia minimamente invasiva.

Formação especializada no âmbito da Radiologia e Diagnóstico por Imagem aborda como atividades a avaliação diagnóstica por meio de métodos de imagem, incluindo raios-X, ultrassonografia, tomografia computadorizada e ressonância magnética, que podem diagnosticar e auxiliar no tratamento adequado de uma ampla variedade de patologias. Além do diagnóstico, também são realizados procedimentos invasivos e terapêuticos, incluindo a radiologia intervencionista.

O programa de Residência em Medicina Intensiva tem como objetivo fornecer conhecimento teórico e treinamento prático, dentro da Unidades de Terapia Intensiva, garantindo que médicos tenham treinamento em alta complexidade, através de muitas discussões clínicas e científicas, permitindo a abordagem e manejo adequado de pacientes críticos, das mais diversas especialidades ou patologias de base.

O programa de residência médica em cardiologia do Hospital Ministro Costa Cavalcanti tem por objetivo a formação de cardiologistas capacitados para exercer diagnósticos e tratamentos por meio de treinamento de raciocínio clínico baseado em conhecimentos teóricos e práticos. Esse modelo de formação médica é muito utilizado nas atividades em cada estágio da residência. Os residentes atuam em atividades de cardiologia geral, unidades de terapia intensiva (cardiologia intensiva, UTI coronariana e insuficiência cardíaca avançada), emergências e métodos diagnósticos (métodos gráficos, ecocardiografia, diagnóstico por imagem, dinâmica do fluxo sanguíneo), além de hemodinâmica e cirurgia cardíaca.

A residência em Cirurgia Oncológica visa desenvolver o conhecimento e a prática no ensino e na pesquisa para pacientes com indicação para tratamento cirúrgico, como nas áreas de ginecologia e mama, torácica, cabeça e pescoço, urologia e medicina paliativa. E tem enfoque em procedimentos diagnósticos, estadiamento, acompanhamento da doença, indicações cirúrgicas com avaliação Pré-operatória, tratamento cirúrgico de alta complexidade, controle pós-operatório, identificação de possíveis complicações e resultados do tratamento. Além de conhecimentos básicos de quimioterapia, radioterapia e cuidados paliativos.